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代谢组学技术培训,代谢组学技术培训心得体会

培训网 2023-12-21 14:20:22 技术培训 0

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于代谢组学技术培训的问题,于是小编就整理了2个相关介绍代谢组学技术培训的解答,让我们一起看看吧。

代谢组学怎么筛选差异代谢物质?

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代谢组学技术培训,代谢组学技术培训心得体会

将待测样本用4℃预冷的pbs清洗2次,加入超纯水匀浆,涡旋,加入提取液,涡旋,超声破碎2次,沉淀,离心,将上清冷冻干燥后得到粉状代谢混合物,将代谢混合物于-80℃下冻存,备用;

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先将第一步冻存的代谢混合物复溶...

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确定每种代谢物质;

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筛选显著性差异代谢物质。

方法主要有以下三种:

1.

倍数变化法(FC值)

2.

T检验法(P值、FDR值)

3.

(O)PLS-DA法(VIP值) 一、倍数变化发 倍数变化法即根据代谢物的相对定量或绝对定量结果,计算某个代谢物在两组间表达量的差异倍数(Fold Change),简称FC值。假设A物质在对照组中定量结果为1,在疾病组中定量结果为3,那么此物质的FC值即为3。

代谢组学可以通过以下三步骤来筛选差异代谢物质:明确结论+原因+1. 筛选代谢物:第一步是通过代谢组学技术手段如质谱或核磁共振等,对研究对象的生物体液、组织、细胞等进行代谢物的筛选和检测。
2. 鉴定差异代谢物:第二步是对筛选得到的代谢物进行差异分析,确定其中具有显著差异性的分子,这些分子即为差异代谢物。
3. 分析差异代谢物:第三步是对差异代谢物进行结构分析、生物学功能的鉴定和途经分析,深入探究它们在生物学系统中调节和影响的机理,以期更深层次地疾病发生、发展的分子机制。
因此,代谢组学通过上述步骤在分子层面上为疾病的早期诊断、评估和分子机制研究提供了重要工具和手段。

代谢组学通常使用统计方法来筛选差异代谢物质。一般来说,可以采用单变量分析(如t检验)或多变量分析(如主成分分析、偏最小二乘法回归等)来鉴定在不同条件下显著变化的代谢物。同时也需要进行多重比较校正和验证实验以保证结果的可靠性。

组学的概念及分类?

分子生物学中,组学(Omics)主要包括基因组学(Genomics),蛋白组学(Proteinomics),代谢组学(Metabolomics),转录组学(transcriptomics),脂类组学(lipidomics),免疫组学(Immunomics),糖组学(glycomics )和 RNA组学(RNomics)学等.

Omics是组学的英文称谓,它的词根'-ome'英译是一些种类个体的系统集合,例如Genomics(基因组学)是构成生物体所有基因的组合,这门学科就是研究这些基因以及这些基因间的关系.

1. 组学是研究生物体中所有组分的整体性质和相互关系的学科领域。
2. 组学可以分为两大类:功能组学和结构组学。
功能组学主要研究生物体中各种分子的功能和相互作用,如基因组学、蛋白质组学和代谢组学等;结构组学则关注生物体中各种分子的结构和空间组织,如基因组学、蛋白质组学和代谢组学等。
3. 组学的发展使得我们可以更全面地了解生物体的内部机制和生命活动的调控,有助于揭示疾病的发生机制、寻找新的治疗方法,并推动了个性化医学的发展。
此外,随着技术的进步和数据的积累,组学研究也在不断拓展,涉及到更多的生物学领域和应用领域,为科学研究和医学进步提供了重要支持。

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